1 .物流業很難得到賬單
個人司機和散戶也沒有簽訂合同。相關費用雖然是實際支出，但是合規單據不足，企業利潤虛增，企業所得稅繳納得多。另外，在租賃卡車的過程中，很難得到增值稅專用的發票，企業會繳納很多增值稅。
2 .增值稅的進口扣除少
企業進口稅發票需經稅務機關驗證后扣除，但運輸行業增值稅扣除困難，一般企業的進口結構包括燃料、汽車購買、維護、站點租賃等，運輸司機、裝卸工人等人工費非常高，但將增值稅專用發票作為進口扣除由于運輸企業的進口總額僅占銷售項目的40%到60%，所以運輸行業的增值稅負壓力也很大。
3 .管理混亂，稅務風險大
運輸企業人員多，據點多，工作流動性大，管理控制弱，有些司機個人購票支付報酬，但運輸企業財務人員稅務管理素質低，無法正確識別發票真偽，購票是虛開發票，增加企業稅務風險。
4 .社保負擔沉重
由于運輸企業準入門檻低、員工文化低、臨時工多、人員流動率大，企業繳納社會保險復雜、成本增加。
如上所述，物流行業稅負壓力非常大，并且有些運輸企業不能及時把握我國相關稅務支持政策，無法及時為自己謀求長期的發展和利益。所以運輸企業現在要轉變，可以選擇實力強的網運企業，在保證企業稅收合規的基礎上，降低成本，增加收入，提高整體市場競爭力。此外，同時實現汽車商品的智能匹配，也能達到降低成本的目的。
